Martínez Molecular Modeling Group

Students and Post-docs

• Dr. Wilson Alberto Tárraga (Postdoc)
• Dr. Jéssica Araújo (Postdoc)
• Dr. Camila Tavares (Postdoc)
• Eduard D. S. Mourão (PhD)
• Pamella Cristiny Carneiro da Silva (PhD)
• Lucas Verona de Araujo (PhD)
• Lucas Avila Pinheiro (PhD)
• Ana Beatriz Lima (MSc)
• Brenda Kathleen de Almeida (MSc)

Former Members

Post-docs

• Dr. Felipe Cardoso Ramos
• Dr. Gabriel E. Jara
• Dr. Ricardo N. Santos

Doctorate Students

• Ander Francisco Pereira — PhD, IQ/UNICAMP, 2025
  Efeitos de solvente na termodinâmica do enovelamento de proteínas. [PDF]
• Vinicius Piccoli — PhD, IQ/UNICAMP, 2025
  Efeitos de íon-comum e múltiplos eletrólitos na solvatação de proteínas por líquidos iônicos. [PDF]
• Guilherme Fahur Bottino — PhD, IQ/UNICAMP, 2024
  Previsão da estrutura secundária de proteínas por processamento de sequências empregando um modelo de linguagem acessível e ultra-paralelizado. [PDF]
• Tayane H. Siqueira — PhD, IQ/UNICAMP, 2020
  Simulações Moleculares da Inibição da Biossíntese de Esteróis em Ortólogos da Enzima Esterol 14α-Desmetilase-CYP51. [PDF]
• Álvaro J. Lopez — PhD, IQ/UNICAMP, 2019
  Estudo Computacional da Fluorescência do Triptofano em Proteínas por meio de Simulações de Dinâmica Molecular. [PDF]
• Luciano B. Censoni — PhD, IQ/UNICAMP, 2019
  Modelos baseados em contatos no estudo do enovelamento e da difusão térmica em proteínas. [PDF]
• Ivan Pires de Oliveira — PhD, IQ/UNICAMP, 2017
  Dinâmica Molecular da Enzima BCL (Burkholderia cepacia lipase): Aspectos da Solvatação e Abertura do Sítio Catalítico na Presença de Osmólitos e em Interfaces. [PDF]
• Mariana R. B. Batista — PhD, IQ/UNICAMP, 2016
  Diversidade Conformacional da Hélice 12 do Receptor PPARγ e suas implicações funcionais. [PDF]
• Leonardo H. F. Lima — PhD, IFSC/USP, 2011
  Estudos por modelagem e dinâmica molecular integradas a técnicas físicas para biomoléculas em solução - interação de receptores nucleares a elementos responsivos no DNA e dinâmica inter-domínios da celobiohidrolase I. [PDF]

Master Students

• Pamella Cristiny Carneiro da Silva — MSc, IQ/UNICAMP, 2023
  Estudo de Dinâmica Molecular do mecanismo de interação antígeno-anticorpo da proteína AMA1 do Plasmodium falciparum. [PDF]
• Diego Pimenta de Carvalho — MSc, IQ/UNICAMP, 2022
  Uma perspectiva dinâmica sobre os dados de ligação cruzada XL-MS. [PDF]
• Vinicius Piccoli — MSc, IQ/UNICAMP, 2020
  Estudo da solvatação de proteínas por líquidos iônicos usando funções de distribuição de mínima-distância. [PDF]
• Guilherme Fahur Bottino — MSc, IQ/UNICAMP, 2019
  Métodos Estatísticos de Seleção de Restrições "Cross-Linking" para a Determinação Assistida de Estruturas de Proteínas. [PDF]
• Antônio Elias Gomes Antonelo — MSc, IQ/UNICAMP, 2018
  Estudo Computacional do Controle Enantiomérico da Reação de Acetilação do Bisfenol Catalisada por um Tetrapeptídeo. [PDF]
• Emília Pécora de Barros — MSc, IQ/UNICAMP, 2015
  Estudo computacional da solvatação e anisotropia de fluorescência resolvida no tempo de subtilisina Carlsberg em misturas de água e glicerol. [PDF]
• Heloisa dos Santos Muniz — MSc, IFSC/USP, 2013
  Estudo da difusão térmica em proteínas termoestáveis. [PDF]
• Mariana R. B. Batista — MSc, IFSC/USP, 2013
  Mobilidade da hélice 12 de receptores nucleares: comparação entre simulações de dinâmica molecular e experimentos de anisotropia de fluorescência. [PDF]
• Luciano Borges Censoni — MSc, IFSC/USP, 2013
  Dinâmica molecular e redes complexas no estudo da difusão térmica em Xilanases da família 11. [PDF]

Scientific Initiation

• Lucas Verona de Araújo
• Rafael Alcides Vicente
• Iago Teixeira de Souza e Silva
• Emília Pécora de Barros
• Matheus Mantovani