Martínez Molecular Modeling Group

Institute of Chemistry and Center for Computing in Engineering and Science

University of Campinas

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   Leandro Martínez
Is a bachelor in Chemistry (2002), Master in Physical Chemistry (2003) and Doctor in Sciences (2007) from the State University of Campinas (UNICAMP). Has held post-doctoral positions at Unicamp and at the Unitè de Bioinformatique Structurale of the Institut Pasteur, in Paris. [CV Lattes]

Students and Post-docs

  		• Dr. Jéssica Araújo (Postdoc)
  		•  Dr. Camila Tavares (Postdoc)
  		•  Dr. Felipe Cardoso Ramos (Postdoc)
  		•  Ander Francisco Pereira (PhD)
  		•  Eduard D. S. Mourão (PhD)
  		•  Vinicius Piccoli (PhD)
  		•  Pamella Cristiny Carneiro da Silva (PhD)
  		•  Ana Beatriz Lima (Msc)
  		•  Brenda Kathleen de Almeida (Msc)
  		•  Lucas Verona de Araújo (IC)
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    Former members


    Post-docs
  		•  Dr. Gabriel E. Jara
  		• Dr. Ricardo N. Santos

    Doctorate students
  		•  Guilherme Fahur Bottino
    Doutor em Ciências, IQ/UNICAMP, 2024. Previsão da estrutura secundária de proteínas por processamento de sequências empregando um modelo de linguagem acessível e ultra-paralelizado. [PDF]
  		• Tayane H. Siqueira
    Doutor em Ciências, IQ/UNICAMP, 2020. Simulações Moleculares da Inbição da Biossíntese de Esteróis em Ortólogos da Enzima Esterol 14α-Desmetilase-CYP51. [PDF]
  		• Álvaro J. Lopez
    Doutor em Ciências, IQ/UNICAMP, 2019. Estudo Computacional da Fluorescência do Triptofano em Proteínas por meio de Simulações de Dinâmica Molecular. [PDF]
  		• Luciano B. Censoni
    Doutor em Ciências, IQ/UNICAMP, 2019: Modelos baseados em contatos no estudo do enovelamento e da difusão térmica em proteínas. [PDF]
  		• Ivan Pires de Oliveira
    Doutor em Ciências, IQ/UNICAMP, 2017: Dinâmica Molecular da Enzima BCL (Burkholderia cepacia lipase): Aspectos da Solvatação e Abertura do Sítio Catalítico na Presença de Osmólitose e em Interfaces. [PDF]
  		• Mariana R. B. Batista
    Doutora em Ciências, IQ/UNICAMP, 2016: Diversidade Conformacional da Hélice 12 do Receptor PPARγ e suas implicações funcionais. [PDF]
  		• Leonardo H. F. Lima
    Doctor in Physics, IFSC/USP 2011: Estudos por modelagem e dinâmica molecular integradas a técnicas físicas para biomoléculas em solução - interação de receptores nucleares a elementos responsivos no DNA e dinâmica inter-domínios da celobiohidrolase I [PDF]

    Master students
  		•  Pamella Cristiny Carneiro da Silva
    Mestrado em Química - IQ/UNICAMP 2023: Estudo de Dinâmica Molecular do mecanismo de interação antígeno-anticorpo da proteína AMA1 do Plasmodium falciparum. [PDF]
  		• Diego Pimenta de Carvalho
    Mestrado em Química - IQ/UNICAMP 2022: Uma perspectiva dinâmica sobre os dados de ligação cruzada XL-MS. [PDF]
  		• Vinicius Piccoli
    Mestrado em Química - IQ/UNICAMP 2020: Estudo da solvatação de proteínas por líquidos iônicos usando funções de distribuição de mínima-distância. [PDF]
  		• Guilherme Fahur Bottino
    Mestrado em Química - IQ/UNICAMP 2019: Métodos Estatísticos de Seleção de Restrições "Cross-Linking" para a Determinação Assistida de Estruturas de Proteínas. [PDF]
  		• Antônio Elias Gomes Antonelo
    Mestrado em Química - IQ/UNICAMP 2018: Estudo Computacional do Controle Enantiomérico da Reação de Acetilação do Bisfenol Catalisada por um Tetrapeptídeo. [PDF]
  		• Emília Pécora de Barros
    Mestrado em Química - IQ/UNICAMP 2015: Estudo computacional da solvatação e anisotropia de fluorescência resolvida no tempo de subtilisina Carlsberg em misturas de água e glicerol. [PDF]
  		• Heloisa dos Santos Muniz
    Mestrado em Física - IFSC/USP 2013: Estudo da difusão térmica em proteínas termoestáveis. [PDF]
  		• Mariana R. B. Batista
    Mestrado em Física - IFSC/USP 2013: Mobilidade da hélice 12 de receptores nucleares: comparação entre simulações de dinâmica molecular e experimentos de anisotropia de fluorescência. [PDF]
  		• Luciano Borges Censoni
    Mestrado em Física - IFSC/USP 2013: Dinâmica molecular e redes complexas no estudo da difusão térmica em Xilanases da família 11. [PDF]

    Scientific initiation
  		•  Rafael Alcides Vicente
  		•  Iago Teixeira de Souza e Silva
  		•  Emília Pécora de Barros
  		•  Matheus Mantovani